中国科学院昆明动物研究所、云南省文物考古研究所等单位研究人员，对云南蒙自马鹿洞发现的“蒙自人”头骨化石开展古DNA遗传学分析研究，发现“蒙自人”与最早的美洲原住民存在深度的古老祖源遗传联系。
马鹿洞“蒙自人”的发现
马鹿洞位于我国云南东南部的蒙自市，处于东南亚热带北部边缘，受西南和东亚季风气候影响，是更新世（距今约260万年至1万年）末期的含化石的人类活动洞穴遗址。
马鹿洞洞口开口于西南方向，洞口宽8.2米，高9.5米，深3米以上。遗址分布面积200余平方米，文化层堆积厚达5米。1989年10月，因当地老百姓采石，偶然发现了这个早已自然封闭的遗址。当时经云南省博物馆古人类研究室、红河州文物管理所和蒙自县文化馆抢救性发掘，出土了包括一个经人工对称钻孔头盖骨、被火烧过的头盖骨和较完整的近端股骨等人类化石30余件，并发现了用火遗迹。马鹿洞发现的这些早期人类俗称为“蒙自人”或“马鹿洞人”。
源自“走出非洲”的早期现代人
我们用“蒙自人”的头盖骨碎片材料开展了古DNA分析，用遗传学的研究手段鉴定“蒙自人”头盖骨代表的个体为亚洲早期现代人女性，而非古老型人类。
“蒙自人”的母性遗传世系，属于一种未知的东亚现代人群线粒体M9支系，而现生人群的M9支系主要分布于喜马拉雅地区的藏缅人群和东南亚群岛的南岛语族（8000年前的福建“亮岛人”属于这个分支）中。
过去对现代人群的研究表明，M9支系可能在2.6万年前产生于中国南方和东南亚接壤的地区，在末次盛冰期以后分别快速扩散到了喜马拉雅地区和东南沿海地区。因此，“蒙自人”的源头是“走出非洲”、约6万年前至5万年前定居到亚洲南部的早期现代人。
现代人起源已明朗
全世界现代人群的主体起源和迁徙历史，现在总体是比较明朗的，只是对一些细节和具体的历史事件，会有不同的观点和争议。
解剖学意义上的现代人，起源于大约20万年前的非洲，在非洲大陆演化了约10万年之后，于约10万年前，早期现代人开始走出非洲扩散到世界各地。研究认为，现代人在扩散到世界各地之前，在中东地区停留了4万年至5万年以后才扩散出来，在该地区还与尼安德特人等欧亚大陆的古老型人类发生了遗传混合，所以，现在所有人身上都携带有1%-3%的尼安德特人基因。
从中东地区分道扬镳之后，一部分人群往欧洲迁徙，一部分人群往亚洲和大洋洲等地区迁徙。一般认为，早期现代人是通过“南线”沿着海岸线迁徙，约6万年前至5万年前进入了东亚南部地区，而后由南向北迁徙进入了东亚腹地，其中一部分人群经过东北亚地区，约2万年前跨过白令海峡到达了美洲大陆。
“黄皮肤”特征或形成于7500年前。近年来有许多的证据发现，约4万年前至1.8万年前，也有一部分早期现代人是通过“北线”迁徙进入了东亚，不过这部分人群对现代东亚人群的遗传贡献相对较少。
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